As Pró-Reitorias são unidades de gestão que apoiam a Reitoria na administração das atividades acadêmicas e administrativas da UFPE:
- PROGRAD — Pró-Reitoria de Graduação
- PROPESQ — Pró-Reitoria para Assuntos de Pesquisa e Pós-Graduação
- PROEXC — Pró-Reitoria de Extensão e Cultura
- PROAES — Pró-Reitoria para Assuntos Estudantis
- PROGEPE — Pró-Reitoria de Gestão de Pessoas
- PROAD — Pró-Reitoria de Administração
- PROPLAN — Pró-Reitoria de Planejamento, Orçamento e Finanças