A UFPE possui 11 centros acadêmicos distribuídos em três campi:
Campus Recife
- CIn — Centro de Informática
- CTG — Centro de Tecnologia e Geociências
- CCS — Centro de Ciências da Saúde
- CAC — Centro de Artes e Comunicação
- CB — Centro de Biociências
- CCEN — Centro de Ciências Exatas e da Natureza
- CCSA — Centro de Ciências Sociais Aplicadas
- CE — Centro de Educação
- CFCH — Centro de Filosofia e Ciências Humanas
Campus Caruaru
- CAP — Centro Acadêmico do Agreste
Campus Vitória de Santo Antão
- CCAB — Centro de Ciências Agrárias e Biológicas